Plateforme CISA

Plateforme labellisée de Sorbonne Université UMS PASS, partie intégrante du réseau des plateformes LUMIC-Sorbonne, labellisé par le GIS-IBISA depuis 2018.

La plateforme CISA assure la mise à disposition des équipements et de l’infrastructure après formation des utilisateurs. Elle met en place la prestation de service avec prise en charge de tout ou partie d’un projet de recherche. Un travail de conseil et/ou de mise au point expérimentale est effectué en collaboration avec l’utilisateur.

Les équipements d'analyse cellulaire disponibles sont des cytomètres en flux (1 analyseur et 1 trieur), 1 système xCELLigence, 1 microscope confocal LEICA SP2, 1 microscope Spinning disk LEICA et un vidéomicroscope Olympus équipé d’une chambre thermostatée.
Les équipements sont accessibles aux équipes du Centre de Recherche Saint-Antoine, aux laboratoires institutionnels extérieurs (dans ou hors Sorbonne Université) et aux organismes privés. La plateforme participe également à la formation académique et continue.

Notre expertise porte sur l’acquisition et l’exploitation de données en Biologie et Santé, par les approches expérimentales suivantes :

• cytométrie en flux (analyse et tri)
• impédance-métrie (xCELLigence)
• imagerie cellulaire d’échantillons vivants ou fixés (microscopie confocale, spinning disk, microscopie dynamique)
• analyse et traitement d’images

• Étudier vos besoins et effectuer l’analyse de faisabilité et le développement méthodologique
• Assurer la formation sur les équipements : cytomètre analyseur, microscopes et modules xCELLigence
• Assurer la formation sur les méthodes d’analyse de données obtenues sur des logiciels adaptés
• Produire les résultats sur mesure :  des données brutes à leur traitement et interprétation pour des rapports finalisés
• Garantir la confidentialité des données et des résultats

• Suivi en temps réel de l’adhérence, la migration et la prolifération cellulaire par impédance-métrie (xCELLigence).
• Analyse du cycle cellulaire par cytométrie en flux : mesure du contenu en ADN, quantification de la réplication (BrdU, EdU), quantification de la mitose (P-histone H3, MPM-2), Ki-67.
• Quantification de l’apoptose par cytométrie en flux (annexine V, TUNEL, cytochrome c)
• Tri de cellules et de particules subcellulaires après immuno-marquage ou expression de protéines fluorescentes (GFP, YFP, …).
• Acquisition et traitement d’images de microscopie (Contraste de phase, DIC, fluorescence), reconstruction 3D, time-lapse.
• Développement de méthodes spécifiques d’analyse d’images : macros sous ImageJ ou Cellprofiler, segmentation d’image et intelligence artificielle sous Ilastik ou Dragonfly (comptage automatique des noyaux, analyse semi-automatique des expériences de wound healing, calcul et classement automatique des surfaces adipocytaires…).
   

Ouvert aux établissements privés ou publics.
Devis sur demande.